Управление образовательной организацией осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации
и Уставом МОБУ Новобурейской СОШ №3.
Структуру органов управления ОО образуют:
Управляющий Совет МОБУ Новобурейской СОШ №3
Педагогический Совет МОБУ Новобурейской СОШ № 3
Общее собрание МОБУ Новобурейской СОШ №3
Школа структурных подразделений - не имеет.